Сериал начинается с того, что Майкл Скофилд, блестящий инженер-строитель, совершает преступление, чтобы попасть в тюрьму. Его цель — не собственная свобода, а спасение его старшего брата Линкольна Барроуза, который находится в камере смертников в тюрьме Фокс Ривер и, как считает герой, несправедливо осуждён за убийство брата вице-президента США.
Замысел Майкла детально проработан: на его теле нанесена татуировка в виде плана учреждения с секретными подсказками для побега. В течение первых сезонов он строит сложный план побега, вовлекая в его реализацию как заключённых союзников, так и ключевых сотрудников учреждения.
Братская любовь и жертвенность — основная движущая сила сериала, мотивирующая героев на борьбу. Линкольн и Майк постоянно рискуют своими жизнями ради друг друга, демонстрируя силу семейных уз. Справедливость против системы — герои сталкиваются с коррумпированной правовой системой и мощными политическими интригами. Их борьба — это не только сражение за свободу, но и за истину. Инженерия и интеллект — Майк, как умный и аналитический мыслитель, использует свои навыки и знания для преодоления невероятных преград. Его подход к решению проблем впечатляет и интригует.